侵入性治疗。为了实施PGD，我们需要提取胚胎的一部分（胚胎的活检）做基因检验。然而，如果在发育的第5天实行胚胎活检，胚胎活检对胚胎活力没有负面影响。
诊断后胚胎数量减少。PGD只需要挑选基因健康的胚胎，即使年轻和健康的父母，也不会所有的胚胎都通过PGD。PGD后可能难以接受的胚胎数量减少，对于超过30岁的患者来说更难，因为遗传异常的几率变大。
周期没有移植。在某些情况下，当患者具有很高的遗传异常风险时，特别是胚胎产生数量较低时，没有一个胚胎似乎适合移植时，这意味着胚胎移植将被取消。
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