在评价卵巢储备功能方面，抗缪勒管激素（AMH）检测可弥补传统激素检测的不足，快速有效地知道卵巢储备能力高低。
女性的生育能力与其卵巢储备功能和体内的各类生殖激素具有密切的关系。卵巢储备能力的不足，会导致女性衰老提前，出现月经周期延长、心血管问题加重，甚至会导致绝经、更年期、不孕等症状。
正确评价卵巢储备功能是预防女性衰老、防治不孕症的关键，AMH检测在临床中有如下应用：
评估卵巢储备功能
相比较其他传统的生物学指标，AMH在评估卵巢储备方面有很多明显的优点，是卵巢衰老最准确的生物标志物。AMH比FSH、雌二醇（estradiol,E2）、抑制素B（inhibinB,inhB）和窦卵泡计数（antra1 follicle count,AFC）更早反映卵巢储备随年龄下降的趋势，且其水平不受月经周期、激素类避孕药和怀孕的影响。虽然有研究显示，女性尤其是年轻女性月经周期内AMH存在一定波动，但其波动远小于其他性激素，故现有指南多支持在月经周期任意时间检测AMH。另外，Fanchin等比较了AMH和其他卵巢储备标志物在不同月经周期间的重复性，AMH是满足组内相关系数>0.8的激素，说明AMH在月经周期之间的变异也较小。因此，AMH是卵巢储备功能指标中最为稳定和可靠的一个。
评估肿瘤患者卵巢储备
手术、化疗、放疗都有可能影响肿瘤患者的卵巢储备功能。10年的跟踪研究显示，儿童肿瘤幸存者的AMH水平显著低于健康同龄人，且伴随不孕比例不断增加。在乳腺癌患者中，术前AMH水平较低的患者术后一年内恢复月经的概率更低。接受卵巢囊肿剥除术的患者中，使用电凝术止血患者的AMH水平较使用缝合或止血材料的患者更低。此外，化疗前评估血清AMH的水平可用于预测化疗后卵巢功能。一项前瞻性研究显示，早期乳腺癌患者治疗前AMH水平越低越易在化疗之后闭经。肿瘤患者化疗后AMH水平恢复的速度与化疗药物的卵巢毒性成反比。由此可见，AMH水平可以预测肿瘤患者的卵巢功能，帮助希望保留生育功能的患者选择药物和手术方式。
辅助生殖
AMH水平可准确预测患者对控制下卵巢刺激（controlled ovarianstimulation,COS）的反应，并据此选择个性化治疗方案。Broer等的一项Meta研究显示，AMH水平用于预测卵巢低反应（poor ovarian response,POR）的曲线下面积为0.81，显著高于年龄、基础FSH水平和AFC。卵巢过度刺激综合征(ovarian hyperstimulation syndrome,OHSS)是辅助生殖促排卵技术的主要并发症之一，而AMH水平可较好预测OHSS。一项多中心前瞻性研究建立了中国人群使用AMH水平预测促排卵患者发生卵巢低反应的切点值为1.1 ng/ml，预测卵巢过度刺激的切点值为2.6 ng/ml。
Nelson等发表了MERIT和MEGASET两项多中心研究结果，其中19家使用促性腺激素释放激素（gonadotropin-releasinghormone,GnRH）激动剂长方案的中心和18家使用GnRH拮抗剂方案的中心中，各有15家显示了AMH与获卵数的斯皮尔曼相关系数显著高于AFC，说明AMH预测获卵数的能力强于AFC。La Marca等的Meta研究则建议了以AMH为依据的个体化促排卵方案，即当患者AMH水平较高，卵巢过度刺激风险较大时，应采用GnRH拮抗剂+最小剂量FSH刺激方案；当患者AMH水平较低，卵巢低反应风险较大时，可采用GnRH拮抗剂+最大剂量FSH刺激方案。但AMH在预测排卵应用中也存在一定的局限性，即虽然可以很好地预测卵母细胞的数量，但不能反映卵子的质量。
诊断多囊卵巢综合征
与健康排卵妇女相比，排卵多囊卵巢综合征（poly-cystic ovarian syndrome，PCOS）患者卵泡液中AMH的浓度比正常值高出5倍。此外，与正常卵巢的颗粒细胞相比，无排卵PCOS的颗粒细胞中每个颗粒细胞产生的AMH平均增加75倍。另一项研究显示，PCOS女性的血清AMH水平较正常排卵女性升高2～3倍，且血清AMH水平越高，PCOS确诊率越高，当AMH水平>10 ng/ml时，PCOS的确诊率可达到97%～100%。由于检测方法和受试人群的差异，AMH水平用于诊断PCOS的切点值尚不统一，从2.8～8.4 ng/ml不等。
预测绝经期及诊断卵巢早衰
Broer等检测了257例年龄在21～46岁且月经正常女性的AMH、AFC和FSH水平，11年后其中48例绝经，将绝经年龄与以上各因素进行Cox回归，经年龄调整后的数据显示仅AMH水平可以很好地预测绝经年龄。Dolleman等的研究则提示AMH是比母亲绝经年龄更好预测女性绝经年龄的指标；其另一项研究则显示，在包含了年龄、体重指数、年吸烟量和月经周期状态的多因素预测模型中加入AMH，可以显著提高这一模型预测10年内绝经概率的能力。Knauff等的研究显示，卵巢早衰人群中仍有相当一部分血清FSH水平低于诊断切点值40 IU/ml，而血清AMH水平几乎100%低于绝经参考浓度，说明AMH能够比FSH更好地区分卵巢早衰。
其他临床应用
AMH已被证实是颗粒细胞肿瘤的一个特异循环指标，它的诊断敏感度在76%～93%；且血清AMH水平与卵巢颗粒细胞肿瘤的大小成正比，与影像学的结果有直接相关性。AMH也可比其他临床指标早11个月提示颗粒细胞肿瘤的复发。
在双侧无法触及睾丸的男孩中，如血清中可检测到AMH，说明有睾丸组织的存在，2014年美国泌尿外科学会（AmericanUrological Association，AUA）隐睾症评估和治疗指南也推荐血清AMH检测用于隐睾症和无睾症的鉴别诊断。
